Karl Kopfrkingl travaille dans un crématorium à Prague. Obnubilé par son métier, il est persuadé le libérer l’âme des défunts en effectuant sa tâche. Alors que les forces nazies se rassemblent à la frontière tchèque, son ancien ami, Reineke, le convainc d’être fier de son sang allemand et Karl se met à croire en une race pure. Hanté par ses croyances, il va se servir de son crématorium pour appliquer son obsession idéologique.

La lecture d’un testament : un homme lègue toute sa fortune à sa fille Klára, au détriment de son autre fille Viktoria. Viktoria tient un établissement nommé « la Flûte verte », et voit sa sœur attirer les hommes, contrairement à elle. Vitoria décide alors de tuer Klára, en se procurant un poison indécelable qui la rendra malade et la tuera au bout de quelques semaines. Après avoir versé le poison dans le verre de sa sœur, déçue de ne pas voir de résultats immédiats, Viktoria en donne à un chien de sa maison. Mais son chat siamois Morgiana a peut-être bu à sa place. Pendant ce temps, Klára tombe malade et commence à avoir des hallucinations.

Marek Franc connaît le succès dans un groupe de Prague. Il décide de prendre un peu de repos et se retire à la maison Schwartzstein, la maison où il a grandi dans un village de campagne. Dans l’intention de peindre et de se détendre, il fait bientôt l’expérience de phénomènes étranges dans la maison. Les villageois murmurent des avertissements et une fille qui rend visite à ses amis disparaît mystérieusement.

En 1900, Stepha, jeune fille riche, accepte d’épouser son cousin Pavel qui a accumulé les dettes. Mais celui-ci refuse de consommer le mariage ou de travailler et sa santé décline rapidement.

Alors qu’ils se rendent en Pologne, un homme et une femme tchèques se disputent. La femme sort de la voiture pour se soulager et le conducteur lui roule dessus, la tuant. Pendant ce temps, dans une ville de montagne tchèque, un jeune homme demande des nouvelles de la jeune fille, ce qui éveille l’intérêt de la police.