Tout commence par un chat entre deux internautes aux pseudonymes de Thonggrrrrrl14 et Lensman319. Les deux personnes, respectivement Hayley Stark, adolescente de quatorze ans et Jeff Kohlver, photographe de trente-deux ans, se mettent d’accord pour se donner rendez-vous. Ils font connaissance dans un café-restaurant local, avant de se rendre au domicile de Jeff. Hayley entame un strip-tease tandis que Jeff la photographie.

La ville de Barrow en Alaska connaît un mois sans soleil tous les ans en hiver. Alors que les habitants se préparent, un étranger débarque d’un grand navire et sabote les communications et les moyens de transport de la ville vers le monde extérieur. Le shérif de Barrow, Eben Oleson, enquête sur ces actes criminels tout en apprenant que son ex-femme, Stella, a manqué le dernier avion et doit rester tout le mois. Cette nuit-là, une bande de créatures humanoïdes semblables à des vampires, et dotée d’une force et d’une vitesse surhumaines, attaque et massacre la plupart des habitants, forçant Eben, Stella, le petit frère d’Eben, Jake, et d’autres survivants à se cacher dans le grenier d’une maison.

Bandersnatch est présenté comme un film interactif. Un bref tutoriel, spécifique à l’appareil du spectateur, explique à ce dernier comment faire des choix. Il a ainsi dix secondes pour prendre une décision, ou par défaut une décision sera prise à sa place. Une fois une « partie » terminée, le spectateur a la possibilité de revenir en arrière et de faire un choix différent.

Dans une petite ville du Midwest, un sombre rituel a lieu tous les ans lorsque Jack Dents-de-Scie prend vie et menace les garçons de la ville. Une cruelle course à la survie s’engage.